In de tweede helft van november 1944 bereikten Britse troepen de Maas in Noord-Limburg en kwam het op de oostoever gelegen Afferden in de vuurlinie terecht. Eind 1944 bliezen terugtrekkende Duitse soldaten de molen op, een lot dat talrijke molens in Noord- en Midden-Limburg trof. Hoge gebouwen konden immers als uitkijkpost dienen voor de oprukkende geallieerden. Na de oorlog werden meteen plannen gemaakt om de molen in zijn oude luister te herstellen. Dat ging niet door vanwege de hoge kosten. Toch lukte het om de molen te redden want toen de St. Josephmolen in Heide-Venray in de loop van de jaren vijftig onder de slopershamer viel, werden onderdelen ervan naar Afferden getransporteerd voor de herbouw. In 1958 kon de korenmolen opnieuw in gebruik worden genomen.