Le 28 octobre 1940, la Grèce entra dans la Seconde Guerre mondiale après l'attaque des forces italiennes depuis la frontière gréco-albanaise. Une statue du commandant en chef de l'armée grecque, sur laquelle est gravé le texte de la déclaration publique relative à la guerre gréco-italienne, orne le Parc des Héros.
En face du Parc des Héros se trouve le bâtiment de la célèbre 8e division d'infanterie d'Épire. En février 1913, les chefs des armées ottomane et grecque y signèrent l'accord de libération de Ioannina. Pendant la guerre gréco-italienne (1940-1941), il abrita le quartier général de l'armée grecque. De 1941 à 1944, le bâtiment fut réquisitionné par les forces d'occupation italo-allemandes. Aujourd'hui, il est toujours utilisé par l'armée grecque.
Au cours des premiers mois de 1944, des manifestations contre les occupants eurent lieu au Parc des Héros et devant le bâtiment de la VIIIe division d’infanterie. Le 21 février 1944, des combattants de la Résistance grecque hissèrent le drapeau grec au sommet de la tour de l’horloge, alors que la ville était encore sous occupation nazie.
En octobre 1944, les occupants ont commencé à évacuer la zone à la suite d’une série de combats opposant les combattants de la Résistance grecque aux côtés des forces alliées, aux forces allemandes. Le 15 octobre 1944, les habitants de Ioannina ont accueilli les combattants de la Résistance grecque et les soldats britanniques alliés, et ont célébré ensemble la libération de la ville.