W czasie II wojny światowej lotnisko służyło jako ośrodek szkoleniowy dla wielu jednostek. Ostatecznie liczyło trzy trawiaste pasy startowe i łącznie 18 małych hangarów na samoloty. Od 1942 roku lotnisko służyło jako lądowisko ratunkowe dla różnych dywizjonów szkoleniowych. Ostatecznie bazę zamknięto w 1957 roku, kiedy szkolenia lotnicze zaczęły odbywać się na samolotach odrzutowych, do których trawiaste pasy startowe Harlaxton nie były przystosowane.
Od tego czasu teren został zwrócony do użytku rolnego, a z dawnego lotniska pozostało bardzo niewiele.